156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1894 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
217 aa  427  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  85.07 
 
 
222 aa  321  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  66 
 
 
226 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  63.68 
 
 
215 aa  254  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  49.01 
 
 
208 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  45 
 
 
203 aa  158  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  50.87 
 
 
233 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  49.39 
 
 
214 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  44 
 
 
217 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  48.55 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.51 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  49.7 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  48.52 
 
 
231 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  41.78 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  46.29 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  46.29 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  45.88 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48 
 
 
225 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  43.09 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  45.14 
 
 
232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2518  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 
210 aa  128  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.619064  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  48.47 
 
 
215 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  49.08 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  41.71 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  41.57 
 
 
215 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.47 
 
 
232 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  41.71 
 
 
219 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  43.5 
 
 
212 aa  124  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  42.7 
 
 
218 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  44.58 
 
 
232 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  47.34 
 
 
225 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  44.38 
 
 
213 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  35.98 
 
 
226 aa  122  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  40.48 
 
 
208 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  45.18 
 
 
232 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
232 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  35.75 
 
 
224 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  40.22 
 
 
217 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  42.55 
 
 
257 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  47.62 
 
 
232 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  45.12 
 
 
212 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1330  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.59 
 
 
195 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  38.79 
 
 
220 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.2 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3390  Phosphatidylserine decarboxylase  43.72 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4178  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.35 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3709  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.74 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0242942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
214 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  38.05 
 
 
216 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
214 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  36.63 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  45.35 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  44.19 
 
 
232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.51 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  45.12 
 
 
213 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  42.44 
 
 
262 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  43.35 
 
 
232 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  46.07 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.44 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  43.68 
 
 
232 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  43.78 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  44.25 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  44.25 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  44.89 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  44.24 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  46.06 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.57 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  42.42 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  40.25 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  47.59 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.57 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  43.24 
 
 
215 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  45.09 
 
 
247 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  43.24 
 
 
215 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  41.1 
 
 
219 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  42.37 
 
 
212 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  44.44 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  43.93 
 
 
248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.88 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.88 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.57 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  38.64 
 
 
225 aa  115  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0676  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.56 
 
 
246 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  41.62 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.7 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.7 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  40.62 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  39.43 
 
 
232 aa  114  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>