151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4178 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4178  phosphatidylserine decarboxylase related protein  100 
 
 
229 aa  454  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  36 
 
 
230 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  35.91 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  44.79 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  38.77 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3828  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.62 
 
 
417 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458299  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  43.16 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  42.63 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  37.61 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.84 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  37.61 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.73 
 
 
218 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  40.99 
 
 
220 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  39.13 
 
 
248 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  38.97 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  43.48 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  35.48 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  33.49 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  42.86 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  36.7 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  36.7 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  36.7 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  37.61 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  36.7 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  38.29 
 
 
214 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  37.37 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  38.12 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  38.05 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4218  phosphatidylserine decarboxylase related protein  46.33 
 
 
418 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  41.13 
 
 
233 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  41.03 
 
 
232 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.07 
 
 
221 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.07 
 
 
221 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  37.78 
 
 
212 aa  124  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  36.11 
 
 
219 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  35.94 
 
 
219 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.27 
 
 
237 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  42.11 
 
 
232 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  38.69 
 
 
221 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36 
 
 
236 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  42.11 
 
 
232 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  37.83 
 
 
232 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  38.25 
 
 
216 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  33.91 
 
 
226 aa  122  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.44 
 
 
236 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.49 
 
 
225 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.44 
 
 
236 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.05 
 
 
232 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  38.25 
 
 
224 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  38.07 
 
 
216 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  33.18 
 
 
224 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  37.83 
 
 
247 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  37.68 
 
 
208 aa  121  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0676  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.37 
 
 
246 aa  121  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  34.1 
 
 
215 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  40.53 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  41.03 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  33.64 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  42.35 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.06 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  38.03 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  40.97 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  36.24 
 
 
208 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  34.35 
 
 
232 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.31 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  35 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  35.87 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  36.04 
 
 
232 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  36.04 
 
 
232 aa  118  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0965  phosphatidylserine decarboxylase  37.76 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.196296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6313  Phosphatidylserine decarboxylase  44.2 
 
 
404 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.67 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  37.78 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.89 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  33.91 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  39.9 
 
 
232 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  35.9 
 
 
216 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  39.38 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.89 
 
 
217 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  37.23 
 
 
215 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  34.23 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  41.71 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.15 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  34.8 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  36.17 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4866  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.04 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  38.38 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  34.7 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  31.3 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  38.12 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.93 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  34.98 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.59 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>