145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2518 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2518  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
210 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.619064  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3390  Phosphatidylserine decarboxylase  51.44 
 
 
215 aa  191  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948403  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5233  Phosphatidylserine decarboxylase  45.95 
 
 
257 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  43.2 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  48.8 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  44 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  36.51 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  37.67 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  40.53 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  42.5 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  46.39 
 
 
226 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  43.02 
 
 
224 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.06 
 
 
225 aa  121  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  38.12 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  41.87 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
247 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.1 
 
 
233 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  39.41 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  40.69 
 
 
233 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  39 
 
 
218 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  40.8 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  40.49 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  40.54 
 
 
232 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  36.41 
 
 
212 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  40.54 
 
 
232 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.22 
 
 
236 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.11 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.16 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  46.48 
 
 
215 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  41.58 
 
 
252 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  41.09 
 
 
232 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  39.36 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  39.36 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 
232 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.54 
 
 
237 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  37.91 
 
 
213 aa  111  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  38.94 
 
 
232 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  30.33 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.71 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  40.86 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  40.29 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  36.55 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  37.93 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 
230 aa  109  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 
232 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  38.73 
 
 
213 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.5 
 
 
232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 
226 aa  108  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  39.81 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.07 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  39.88 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  35.16 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0348  phosphatidylserine decarboxylase  34.52 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0565253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  40.72 
 
 
220 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  37.56 
 
 
232 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  35.9 
 
 
217 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  39.09 
 
 
232 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.6 
 
 
236 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.6 
 
 
236 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  39.44 
 
 
194 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  34.02 
 
 
225 aa  105  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1330  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.7 
 
 
195 aa  105  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  39.23 
 
 
232 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
232 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
232 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  38.24 
 
 
217 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3585  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  38.12 
 
 
236 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.289876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  39.05 
 
 
262 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  40.31 
 
 
215 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.99 
 
 
219 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
224 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  40.2 
 
 
216 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  36.1 
 
 
208 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  35.29 
 
 
219 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  37.44 
 
 
215 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.34 
 
 
237 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.9 
 
 
217 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 
212 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3709  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.78 
 
 
240 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0242942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  36.54 
 
 
212 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  36.92 
 
 
215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  39.77 
 
 
218 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  41.67 
 
 
214 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  36.54 
 
 
212 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  37.81 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  37.81 
 
 
214 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  37.81 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.32 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  37.81 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  37.81 
 
 
214 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
214 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>