210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4671 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 310 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  83.88 
 
 		 307 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  83.22 
 
 		 307 aa  524  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  83.55 
 
 		 307 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  82.25 
 
 		 299 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  80.2 
 
 		 299 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  68.25 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  69.55 
 
 		 295 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  68.86 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  69.36 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  66.44 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  66.33 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  63.21 
 
 		 303 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  65.32 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  62.88 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  63.88 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  64.77 
 
 		 303 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  63.3 
 
 		 301 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  62.37 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  63.01 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  59.42 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  61.9 
 
 		 290 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  64.77 
 
 		 304 aa  358  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  58.82 
 
 		 300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  55.52 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  49.84 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  52.35 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  53.36 
 
 		 291 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  51.68 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  48.63 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  53.22 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  52.05 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  44.74 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 		 256 aa  236  5.0000000000000005e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.96 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  43.9 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  41.96 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  42.95 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  42.09 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  44.34 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  44.33 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.96 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  43.29 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  40.62 
 
 		 336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  44.11 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  42.3 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 348 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  41.64 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  41.64 
 
 		 347 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  42.36 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  42.36 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  42.24 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  44.03 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  40.83 
 
 		 348 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  46.33 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  44.6 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  43.77 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  39.7 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  43.81 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  42.39 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.39 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  42.32 
 
 		 347 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  42.39 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  42.07 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  43.6 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  43.73 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  41.97 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  45.32 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>