210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1550 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 303 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  99.34 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  91.45 
 
 		 304 aa  587  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  76.32 
 
 		 304 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  74.34 
 
 		 303 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  73.68 
 
 		 303 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  70.72 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  71.05 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  66.89 
 
 		 295 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  65.8 
 
 		 304 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  66.44 
 
 		 315 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  67.22 
 
 		 295 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  66.33 
 
 		 300 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  65.22 
 
 		 299 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  63.16 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  62.42 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  62.09 
 
 		 307 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  63.21 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  60.47 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  59.87 
 
 		 298 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 		 290 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  64.21 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  58.8 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  59.52 
 
 		 307 aa  348  9e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  57.43 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  51.03 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 		 303 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  53.1 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  52.19 
 
 		 291 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  51.52 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  51.21 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  51.85 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 		 286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  49.33 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  53.14 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  46.71 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  44.82 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  38.44 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  40.28 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  40.14 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  39.18 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  39.52 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  39.19 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  38.49 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  41.09 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  38.49 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 310 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  41.09 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  41.09 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  41.09 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  40.7 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  39.37 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  36.2 
 
 		 348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  40.73 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  40.21 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  36.98 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  38.49 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  39.45 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  40.27 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  38.23 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  38.54 
 
 		 362 aa  195  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>