210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1752 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  77.08 
 
 		 291 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  77.43 
 
 		 291 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  77.08 
 
 		 291 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  72.03 
 
 		 292 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  71.33 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  67.69 
 
 		 300 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  54.45 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  51.89 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  51.53 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  52.56 
 
 		 300 aa  278  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  54.51 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  49.33 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  48.32 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  52.94 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  52.56 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  48.49 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  49.15 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  49.3 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  50.67 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  47.26 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  46.34 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  45.36 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  47.04 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  52.23 
 
 		 286 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  45.97 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  42.36 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  44.95 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  49.15 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  44.98 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  46.89 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  41.04 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  47.62 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  42.47 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  44.52 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 299 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 304 aa  224  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 299 aa  224  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  42.12 
 
 		 299 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  47.93 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  41.29 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  48.95 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  48.95 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  47.52 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  43.73 
 
 		 302 aa  222  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  45.02 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 344 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  43.01 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  43.34 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  42.18 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  44.09 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  44.09 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  43.29 
 
 		 317 aa  219  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  41.84 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  44.09 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  39.62 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  39.62 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>