210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3848 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  76.63 
 
 
300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  75 
 
 
297 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  70.27 
 
 
291 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  70.95 
 
 
291 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  72.03 
 
 
286 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  69.93 
 
 
291 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  56.38 
 
 
304 aa  318  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  54.33 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  52.67 
 
 
300 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  51.39 
 
 
290 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  51.01 
 
 
318 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  50.51 
 
 
307 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  50.85 
 
 
307 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  50.85 
 
 
300 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  50.84 
 
 
295 aa  275  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  52.58 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
304 aa  272  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  48.85 
 
 
303 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 
303 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  48.83 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  47.65 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  51.35 
 
 
287 aa  265  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 
303 aa  265  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  48.79 
 
 
306 aa  264  1e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 
310 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  55.05 
 
 
286 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  47.99 
 
 
303 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  47.28 
 
 
299 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  52.36 
 
 
286 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 
284 aa  250  2e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 
304 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  46.49 
 
 
301 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  48.3 
 
 
299 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  42.66 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  47.01 
 
 
256 aa  232  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 
298 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  43 
 
 
304 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 
303 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
347 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  41.99 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  48.32 
 
 
299 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.03 
 
 
303 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  48.74 
 
 
299 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  48.74 
 
 
299 aa  221  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  48.74 
 
 
299 aa  221  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  46.69 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  48.32 
 
 
299 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  48.32 
 
 
299 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  48.32 
 
 
299 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 
346 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 
346 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
344 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  46.86 
 
 
307 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 
304 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  47.9 
 
 
299 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  40.75 
 
 
306 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 
323 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  45.87 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
347 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 
305 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 
302 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 
302 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
310 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 
312 aa  215  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  38.46 
 
 
348 aa  215  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
323 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
323 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  40.19 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  44.4 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  46.64 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  45.04 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  37.77 
 
 
343 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  45.04 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  45.04 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  43.27 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  44.68 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  37.65 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  41.34 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>