209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2944 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 307 aa  630  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  68.2 
 
 		 300 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  67.13 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  62.37 
 
 		 290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  59.52 
 
 		 303 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  58.5 
 
 		 304 aa  345  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  59.18 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  59.45 
 
 		 299 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  58.5 
 
 		 315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  59.12 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  57.48 
 
 		 304 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  58.02 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  57.34 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  56.46 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  56.82 
 
 		 307 aa  328  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 287 aa  322  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 		 307 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  55.19 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  57.59 
 
 		 300 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  58.95 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  57.97 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  57.43 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  55.52 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  58.08 
 
 		 299 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  53.2 
 
 		 298 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  59.03 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  58.76 
 
 		 286 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  55.56 
 
 		 291 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  52.43 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  55.22 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  52.78 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  55.44 
 
 		 297 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  51.35 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  52.08 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  53.2 
 
 		 291 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  57.14 
 
 		 256 aa  277  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  52.58 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  54.17 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  47.65 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  45.08 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  44.41 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 344 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  45.71 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  45.71 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.71 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  42.42 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  45.36 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  45.1 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  45 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.36 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  48.4 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  49.6 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  44.64 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  45 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  45 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  44.56 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  44.64 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  44.79 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  45 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  42.56 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  46.01 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  41.93 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  44.04 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  44.98 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  41.25 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  43.51 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  45.3 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  46.02 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  44.68 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  42.19 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  44.33 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  43.88 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  40.34 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  40.39 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  45.17 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  41.16 
 
 		 362 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  43.56 
 
 		 312 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  43.39 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  43.3 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>