209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0734 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 318 aa  661    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  66.44 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  67.35 
 
 		 290 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  66.89 
 
 		 295 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  66.67 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  64.51 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  65.51 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  64.07 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  59.74 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 		 300 aa  368  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  59.74 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  59.74 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  59.41 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 304 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  59.47 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  59.14 
 
 		 304 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  58.47 
 
 		 303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  64.07 
 
 		 299 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  58.53 
 
 		 303 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  59.8 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  58.02 
 
 		 304 aa  331  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  57.04 
 
 		 301 aa  328  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  52.9 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  51.3 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  54.67 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  51.51 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 287 aa  311  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  53.87 
 
 		 291 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  53.54 
 
 		 291 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  52.63 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  53.72 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  53.26 
 
 		 286 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  52.01 
 
 		 292 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  56.01 
 
 		 286 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  54.11 
 
 		 286 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  48.98 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  44.56 
 
 		 284 aa  263  4e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  49.6 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  42 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  43.39 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  42.71 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  44.73 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  40.65 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.64 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  39.31 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 302 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  38.99 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  39.81 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  44.69 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  41.46 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  42.47 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  42.14 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  40.46 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  42.4 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  39.79 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  40.34 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 		 343 aa  211  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  39.44 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3201  coproporphyrinogen III oxidase  42.07 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  38.71 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  37.46 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  43.12 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>