210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2536 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 287 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  74.28 
 
 		 286 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  73.38 
 
 		 286 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  59.11 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  55.97 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  54.73 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 307 aa  322  7e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  55.48 
 
 		 315 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  53.66 
 
 		 318 aa  300  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  55.78 
 
 		 300 aa  298  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  52.74 
 
 		 310 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  55.52 
 
 		 303 aa  294  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  55.63 
 
 		 295 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  54.68 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  52.74 
 
 		 298 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  51.01 
 
 		 304 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  51.55 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  52.4 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  50.51 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  52.6 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  51.21 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  53.85 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  51.54 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  54.2 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  53.85 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  52.76 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  50.51 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  50.87 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 		 310 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 307 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  51.35 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 		 304 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  52.6 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  46.04 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  42.51 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  43.45 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  43.01 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  43.25 
 
 		 323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.91 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 347 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.41 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  41.43 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  40.72 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  42.27 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  45.25 
 
 		 454 aa  215  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  40.56 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  44.93 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  44.93 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  44.03 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  44.85 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.34 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1900  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.646946  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  41.44 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  41.44 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  43.4 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  40.39 
 
 		 346 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  40.39 
 
 		 346 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  43 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  40.99 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  40.99 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  40.99 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1705  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0573078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  41.34 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  39.6 
 
 		 348 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  42.2 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  42.11 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  39.41 
 
 		 348 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  43.2 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  40.72 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  40.55 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  38.31 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  37.09 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  40.64 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>