210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1347 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  73.38 
 
 		 287 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  75.79 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  59.03 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  56.31 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  55.25 
 
 		 315 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  56.57 
 
 		 300 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  54.61 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  55.22 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  54.03 
 
 		 303 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  54.48 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  54.42 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  56.76 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  52.68 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  54.45 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  55.03 
 
 		 301 aa  298  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  52.54 
 
 		 298 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  56.08 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 304 aa  295  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  51.17 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  54.58 
 
 		 299 aa  294  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  52.35 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  55.41 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  51.33 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  52.74 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  48.98 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  54.73 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  52.56 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  48.47 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  52.56 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  52.22 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  51 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  48.29 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  54.76 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  51.58 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  53.2 
 
 		 292 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  52.03 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  45.76 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  45.66 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 302 aa  244  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  46.34 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  45.49 
 
 		 323 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  44.95 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  44.6 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  45.96 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.3 
 
 		 304 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  46.38 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  44.79 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  45.49 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  47.14 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  44.1 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  44.1 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  44.1 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  44.1 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  45.3 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  43.6 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  45.49 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  45.14 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  45.32 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  46.07 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  44.01 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 307 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  46.91 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  42.02 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  46.07 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  43.31 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  43.36 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  44.52 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  43.55 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  44.09 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  42.71 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  41.37 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  44.13 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>