210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0647 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 307 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  97.07 
 
 		 307 aa  620  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  96.42 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  83.22 
 
 		 310 aa  524  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  80.27 
 
 		 299 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  81.63 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  69.9 
 
 		 295 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  73.36 
 
 		 295 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  67.52 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  68.6 
 
 		 300 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  66.34 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  63.16 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  64.47 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  64.05 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  65.13 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  65.89 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  62.83 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  62.87 
 
 		 304 aa  384  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  64.47 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  64.19 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  66 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  60.88 
 
 		 290 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  59.41 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  58.86 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  56.82 
 
 		 307 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  49.51 
 
 		 303 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  48.96 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  52.82 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  52.16 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 287 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  51.66 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  51.88 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  53.04 
 
 		 286 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  46.13 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  42.9 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  46 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  43.54 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  43.19 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  49.02 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  44.18 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  43.34 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  45.17 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  42.72 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  47.1 
 
 		 327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 		 375 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  44.83 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  45.28 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  46.51 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  43.73 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  40.6 
 
 		 348 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  42.09 
 
 		 347 aa  208  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 362 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  42.43 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  42.72 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  44.14 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  40.52 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  42.04 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  43.45 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  42.77 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  41.06 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  44.48 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.79 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  45.15 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  39.35 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  44.82 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  43.52 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  43.34 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  44.03 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  41.84 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  41.84 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  45.85 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  40.46 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  39.25 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  40.2 
 
 		 342 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  40.66 
 
 		 342 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 307 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>