210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1949 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
302 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  98.68 
 
 
302 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2014  coproporphyrinogen III oxidase  96.03 
 
 
302 aa  553  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  75.87 
 
 
286 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  52.05 
 
 
300 aa  322  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  58.82 
 
 
327 aa  319  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  51.99 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  50.16 
 
 
345 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  51.28 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 
300 aa  308  6.999999999999999e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  56.25 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  56.25 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  48.63 
 
 
347 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  50.97 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  50.5 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  51.1 
 
 
347 aa  302  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  52.54 
 
 
305 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  51.2 
 
 
292 aa  300  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  49.52 
 
 
346 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  52.2 
 
 
305 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  54.74 
 
 
299 aa  300  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  49.52 
 
 
346 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  53.15 
 
 
304 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 
343 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  47 
 
 
348 aa  296  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1918  coproporphyrinogen III oxidase  47.72 
 
 
299 aa  295  5e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.284298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  52.17 
 
 
298 aa  295  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 
303 aa  294  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  48.54 
 
 
307 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  51.88 
 
 
308 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  52.45 
 
 
304 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  51.7 
 
 
299 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  51.36 
 
 
304 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 
299 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  51.75 
 
 
304 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 
302 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 
299 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  50.46 
 
 
333 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 
375 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
302 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 
302 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 
302 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  51.36 
 
 
299 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  51.36 
 
 
299 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  51.05 
 
 
304 aa  288  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  48.54 
 
 
314 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 
299 aa  288  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
302 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
302 aa  288  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
302 aa  288  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  51.36 
 
 
299 aa  288  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  52.45 
 
 
303 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
323 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  46.2 
 
 
348 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  52.45 
 
 
303 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  52.45 
 
 
303 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 
310 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
302 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  49.35 
 
 
310 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  45.89 
 
 
348 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  51.02 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  49.51 
 
 
362 aa  285  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
316 aa  285  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  52.1 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2162  coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.844234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  48.15 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  50.51 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  52.45 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  52.1 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  48.36 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  52.1 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  52.1 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  50.35 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  51.01 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  51.4 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  51.05 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  51.75 
 
 
299 aa  282  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  47.54 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 
305 aa  281  9e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  45.09 
 
 
454 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 
310 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  52.8 
 
 
306 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  47.78 
 
 
357 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  52.4 
 
 
299 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
305 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  52.16 
 
 
310 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
310 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  47.57 
 
 
312 aa  279  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 
299 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  48.54 
 
 
362 aa  278  8e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 
310 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  50.87 
 
 
306 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64368  Oxygen-repressed protein  45.22 
 
 
323 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  52.1 
 
 
309 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
309 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 
309 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
342 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>