209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0403 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  90.06 
 
 		 362 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 362 aa  747    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  76.58 
 
 		 357 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  74.86 
 
 		 375 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  71.26 
 
 		 348 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  70.98 
 
 		 348 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  69.46 
 
 		 342 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  69.46 
 
 		 342 aa  524  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  69.16 
 
 		 342 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  68.28 
 
 		 342 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  75.4 
 
 		 317 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  70.9 
 
 		 344 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  69.88 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  67.75 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  69.66 
 
 		 347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  68.83 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  68.58 
 
 		 346 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  68.58 
 
 		 346 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  65.64 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  55.31 
 
 		 303 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  54.86 
 
 		 302 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  54.86 
 
 		 302 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  55.38 
 
 		 304 aa  352  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 		 302 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  55.35 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 		 302 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 		 302 aa  349  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 		 302 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  54.23 
 
 		 302 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  55 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  53.92 
 
 		 302 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  53.92 
 
 		 304 aa  345  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  53.11 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 		 310 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  52.15 
 
 		 306 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  54.35 
 
 		 299 aa  338  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 306 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  54.06 
 
 		 299 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  54.06 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  54.06 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  54.06 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  53.75 
 
 		 299 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  50.9 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  53.75 
 
 		 299 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  50.7 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  53.75 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  53.89 
 
 		 298 aa  332  5e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 		 317 aa  332  5e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  53.33 
 
 		 304 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  53.44 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  51.38 
 
 		 305 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  53.46 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  52.66 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 299 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 299 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  52.66 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 299 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  51.85 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  53.29 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  53.29 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  51.69 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  49.24 
 
 		 307 aa  325  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  52.35 
 
 		 309 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  53.31 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  53.31 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  51.71 
 
 		 306 aa  325  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  53.75 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  52.02 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 298 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  51.07 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 303 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 		 323 aa  319  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 		 302 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  50.93 
 
 		 305 aa  319  6e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  50.91 
 
 		 312 aa  319  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  49.54 
 
 		 310 aa  318  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  53.56 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  52.15 
 
 		 306 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  49.7 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  49.7 
 
 		 305 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  50.93 
 
 		 303 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 305 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  51.42 
 
 		 302 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  47.85 
 
 		 311 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  50.31 
 
 		 304 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  49.09 
 
 		 331 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  50.31 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  50.31 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  49.53 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  48.77 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  48.77 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  49.53 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  48.93 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  51.23 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  49.54 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  48.62 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>