209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64368 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_64368  Oxygen-repressed protein  100 
 
 		 323 aa  676    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  52.51 
 
 		 454 aa  374  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  53.21 
 
 		 368 aa  349  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  54.78 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  54.49 
 
 		 304 aa  335  7e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  53.95 
 
 		 292 aa  332  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  49.85 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  51.27 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  51.58 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  47.35 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  47.35 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  47.66 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  47.66 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  49.2 
 
 		 302 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  47.04 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  46.73 
 
 		 307 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  46.27 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  48.87 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  48.87 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  49.52 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  46.42 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  48.55 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  48.17 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  48.23 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  48.23 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  48.23 
 
 		 302 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  47.92 
 
 		 304 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  48.4 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  47.02 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  47.23 
 
 		 298 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  47.18 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  44.72 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  47.59 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  46.69 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  47.92 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  47.88 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  47.33 
 
 		 299 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  48.29 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  47.91 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  47.33 
 
 		 299 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  48.56 
 
 		 303 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  46.52 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  48.56 
 
 		 303 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 309 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  45.1 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 309 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  48.56 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  47.95 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  47.95 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  47.95 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  48.88 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  47.6 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  48.39 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  47.6 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  46.47 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  47.6 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  47.74 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  48.36 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  46.93 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  47.57 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  45.69 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  46.58 
 
 		 286 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  44.51 
 
 		 343 aa  275  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  48.01 
 
 		 317 aa  275  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  48.08 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  48 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  47.26 
 
 		 299 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  48.38 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  45.89 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  45.65 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  47.39 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1970  coproporphyrinogen III oxidase  46.53 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  44.48 
 
 		 342 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  44.31 
 
 		 342 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  48.43 
 
 		 312 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  44.51 
 
 		 348 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  46.49 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2192  coproporphyrinogen III oxidase  45.81 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>