210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1910 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  60.19 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  61.06 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  59.43 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  63.73 
 
 		 304 aa  374  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  61.07 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  63.14 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  62.03 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  58.09 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  62.8 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  56.83 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  55.52 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  55.76 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  55.76 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  55.87 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  58.14 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  63.05 
 
 		 303 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  60.2 
 
 		 317 aa  363  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  59.29 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  57.81 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  60.33 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  58.8 
 
 		 306 aa  362  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  59.47 
 
 		 309 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  59.87 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  59.87 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  59.47 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  57.23 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  59.87 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  59.47 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  59.8 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  56.05 
 
 		 348 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  59.14 
 
 		 307 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  59.33 
 
 		 299 aa  358  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  60.34 
 
 		 304 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  59.33 
 
 		 299 aa  358  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  59.33 
 
 		 299 aa  358  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  58.28 
 
 		 304 aa  358  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  62.16 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  60 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  59 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  57.76 
 
 		 323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  57.76 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  59 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  59 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  57.76 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  59 
 
 		 299 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  58.8 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  57.43 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  58.67 
 
 		 299 aa  355  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  57.43 
 
 		 302 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  58 
 
 		 303 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  60.68 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  57.1 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  57.1 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  59.12 
 
 		 310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  57.1 
 
 		 302 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  58.28 
 
 		 304 aa  352  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  58.62 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 303 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 303 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 		 303 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  51.85 
 
 		 375 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  56.9 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1013  coproporphyrinogen III oxidase  59.27 
 
 		 326 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  57.1 
 
 		 302 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  56.38 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  59.12 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  57.14 
 
 		 304 aa  349  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  57.19 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  59.67 
 
 		 299 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 323 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  59.2 
 
 		 323 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  59.46 
 
 		 298 aa  348  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  56.04 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  55.81 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0794  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  58.53 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1229  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1238  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0356  coproporphyrinogen III oxidase  58.94 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.791354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  57.24 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  58.25 
 
 		 305 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  59.06 
 
 		 307 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  58.28 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  57.19 
 
 		 302 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  55.74 
 
 		 307 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2390  coproporphyrinogen III oxidase  59.87 
 
 		 302 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.967494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  58.05 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  58.39 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  58.86 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  58.86 
 
 		 306 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  53.31 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  58.56 
 
 		 302 aa  341  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>