210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2162 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2162  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 298 aa  624  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.844234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  58 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1918  coproporphyrinogen III oxidase  56.9 
 
 		 299 aa  348  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.284298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  56.23 
 
 		 304 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  45.81 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  47.84 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  44.2 
 
 		 345 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  43.53 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  46.62 
 
 		 302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  46.62 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2014  coproporphyrinogen III oxidase  46.28 
 
 		 302 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 		 342 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  49.82 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  44.51 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 348 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  45.28 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  46.84 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  45.66 
 
 		 317 aa  278  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  44.16 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  44.48 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  46.42 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  48.29 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  45.55 
 
 		 286 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 		 342 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  47.6 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 		 362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  50.18 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  47.95 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  50.18 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  48.29 
 
 		 303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  47.37 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  47.95 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  48.42 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  44.16 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  46.92 
 
 		 304 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  47.84 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  46.58 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 		 342 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  42.63 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  45.05 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  45.85 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  45.89 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  45.58 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  45.99 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  45.1 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  43.14 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 307 aa  262  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  47.52 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  44.76 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  41.77 
 
 		 348 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  46.4 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  44.24 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  44.48 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64368  Oxygen-repressed protein  42.54 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  43 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  43.71 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  45.16 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  45.94 
 
 		 305 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  45.74 
 
 		 306 aa  255  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  46.81 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  45.16 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  46.57 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  44.96 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  44.83 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  44.96 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  44.96 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  45.32 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  44.41 
 
 		 299 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  44.48 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  46.5 
 
 		 454 aa  251  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  44.06 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>