210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1193 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 327 aa  670    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  51.83 
 
 		 300 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6503  coproporphyrinogen III oxidase  54.27 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.602583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 		 344 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  50.76 
 
 		 345 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  48.82 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  53 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  50.9 
 
 		 347 aa  301  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  58.82 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  58.82 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  55.86 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  51.79 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 347 aa  298  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  52.94 
 
 		 304 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  52.63 
 
 		 304 aa  298  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  50.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  49.09 
 
 		 348 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  51.88 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  53.82 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  52.96 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  53.14 
 
 		 302 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  47.51 
 
 		 300 aa  295  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  50.46 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  52.3 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  52.3 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  51.97 
 
 		 302 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  51.97 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  54.05 
 
 		 298 aa  292  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  53.92 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  54.55 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  52 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  50.16 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  52.33 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2014  coproporphyrinogen III oxidase  57.44 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  52.7 
 
 		 299 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  52 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  52 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  52.15 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  52.12 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  52 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  52 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  52 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  52 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  54.03 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  53.54 
 
 		 302 aa  285  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  50.8 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  52.53 
 
 		 310 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 299 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  54.33 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  54.33 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  48.49 
 
 		 362 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  52.49 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  48.69 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  49.09 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  50.98 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22671  coproporphyrinogen III oxidase  47.73 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  50.67 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  49.33 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  45.85 
 
 		 375 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  50.17 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  49.33 
 
 		 305 aa  278  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  51.85 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 		 305 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  47.74 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  52 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  52.84 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  52.84 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  49.54 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1441  coproporphyrinogen III oxidase  55.85 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  50.66 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  44.89 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  51.01 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  48.23 
 
 		 454 aa  275  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  52.84 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  54.03 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  52.51 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  48.67 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  53.02 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  52.51 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  52.01 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  50.18 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0409  coproporphyrinogen III oxidase  49.37 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0203114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  48.67 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  52.51 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  52.01 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>