210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0674 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  75.93 
 
 		 300 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  75 
 
 		 291 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  73.99 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  75 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  70.95 
 
 		 291 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  69.97 
 
 		 286 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  56.81 
 
 		 304 aa  328  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  53.51 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  51.47 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  52.61 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  52.49 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  51.63 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  53.38 
 
 		 300 aa  298  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  55.44 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  50.83 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  52.98 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  52.84 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  50.99 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  50.5 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  51.32 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  50.99 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  50.81 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  48.84 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  50.34 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  48.67 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  47.52 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  46.08 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  49.17 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  42.81 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  45.08 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  49.83 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  46.26 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  45.38 
 
 		 454 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  46.61 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  38.85 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  43.01 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  39.43 
 
 		 347 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  41.39 
 
 		 368 aa  225  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  40.84 
 
 		 336 aa  224  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  41.29 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64368  Oxygen-repressed protein  42.47 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  39.75 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  39.75 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  38.54 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  46.91 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  46.06 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  45.49 
 
 		 303 aa  217  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  40.75 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  43.8 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  41.47 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  44.63 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  44.63 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  40.75 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  41.32 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  43.8 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  44.63 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  40.47 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  44.21 
 
 		 302 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 		 345 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  44.64 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  46.93 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  46.93 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  44.4 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  42.98 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  43.98 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  40.8 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  44.63 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  37.9 
 
 		 375 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  37.54 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  40.54 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>