210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2337 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  98.63 
 
 		 291 aa  590  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  94.5 
 
 		 291 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  77.43 
 
 		 286 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  75 
 
 		 297 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  70.95 
 
 		 292 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  73.38 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  57.33 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  55.56 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  52.65 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  52.72 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  54.73 
 
 		 300 aa  295  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  53.8 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  52.86 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  52.82 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  52.19 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  52.48 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  51.68 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  52.17 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  52.35 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  51.52 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  51.52 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  53.8 
 
 		 300 aa  281  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  52.82 
 
 		 307 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  54.2 
 
 		 287 aa  279  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  53.2 
 
 		 295 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  54.24 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  50.51 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  51.16 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  53.31 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  51.5 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  53.54 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  53.51 
 
 		 286 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  48.61 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  43.25 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  47.35 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  45.76 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  46.6 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  45.79 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  44.44 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  48.09 
 
 		 454 aa  242  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  46.04 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  46.04 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  46.4 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  43.75 
 
 		 304 aa  238  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  45.68 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  44.96 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  45.32 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  46.85 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  40.76 
 
 		 347 aa  235  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  44.96 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  44.96 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  50 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2685  Coproporphyrinogen oxidase  44.41 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  43 
 
 		 310 aa  234  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  47.79 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  43.84 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  46.49 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 		 347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  43.59 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  44.6 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.73 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  47.55 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  49.17 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  43.73 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 		 323 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  44.07 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  48.44 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  44.24 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  47.39 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  49.17 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  49.17 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  49.17 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  49.17 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  48.97 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  48.97 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  48.97 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  49.17 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  48.16 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  48.56 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  48.56 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  48.56 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  38.96 
 
 		 348 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>