209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0699 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  71.19 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  68.37 
 
 		 295 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  71.67 
 
 		 295 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  68.97 
 
 		 300 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  66.32 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  66.33 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  61.77 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  61.46 
 
 		 310 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  62.59 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  63.01 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  61.3 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  62.54 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  62.54 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  61.75 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  61.32 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  62.2 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  61.9 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  65.75 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  60.88 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  60.35 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  60.88 
 
 		 307 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  60.62 
 
 		 303 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  60.2 
 
 		 307 aa  358  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  62.37 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  62.67 
 
 		 299 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  58.59 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  55.37 
 
 		 298 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  54.73 
 
 		 287 aa  322  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  55.99 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  57.63 
 
 		 286 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  52.72 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  51.83 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  52.72 
 
 		 291 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  52.04 
 
 		 291 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  54.95 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  51.39 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  50.17 
 
 		 300 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  47.08 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  52.21 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 362 aa  225  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  42.46 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  43.16 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1154  coproporphyrinogen III oxidase  39.03 
 
 		 348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  38.71 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  37.54 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 342 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  41.38 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.2 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 342 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.7 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  42.61 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  40.42 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  44.36 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  44.36 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  44.36 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 		 303 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  43.61 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  40.2 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  39.48 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  44.29 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  45.42 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  43.22 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  42.46 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  43.23 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>