64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0547 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  98.1 
 
 		 214 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  98.58 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  91.47 
 
 		 214 aa  370  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  82.86 
 
 		 212 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  47.47 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  47.8 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  45.19 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  49.25 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  45.45 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  45.27 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  47.55 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  44.06 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  45.18 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  44.16 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  45.89 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  45.85 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  43.65 
 
 		 250 aa  164  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  44.66 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  42.58 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  43.81 
 
 		 232 aa  157  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  41.98 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  41.98 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  39.9 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  39.81 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  34.16 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  38.24 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  38.58 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  36.45 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  38.35 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  34.83 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  35.92 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  35.32 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  34.62 
 
 		 223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  36.87 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  36.97 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  35.58 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  33 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  31.71 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  34.63 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  31.71 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  31.71 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  32.04 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  33.01 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  32.32 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  31.53 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  33.33 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  36 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  29.56 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  27.78 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  31.58 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  27.92 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  31.25 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  28.22 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  28.08 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  30.29 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  26.9 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  25 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  29.27 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  28.36 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1829  V-type ATP synthase subunit D  29.06 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  21.35 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  25.62 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0092  V-type ATP synthase subunit D  28.07 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>