62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1224 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  74.16 
 
 		 209 aa  307  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  71.29 
 
 		 209 aa  302  3.0000000000000004e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  71.09 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  73.91 
 
 		 208 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  67.82 
 
 		 206 aa  270  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  64.04 
 
 		 207 aa  254  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  57.56 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  56.86 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  57.29 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  56.28 
 
 		 250 aa  234  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  55.28 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  54.64 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  48.1 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  47.62 
 
 		 214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  46.86 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  46.89 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  46.19 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  46.19 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  46.19 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  42.59 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  42.29 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  39.51 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  35.96 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  36.1 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  37.31 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  35.64 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  38.79 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  35.44 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  35.44 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  35.82 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  37.5 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  36.1 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  34.47 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  34.09 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  30.96 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  32.34 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  31.71 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.07 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  33.64 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  29.29 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  32.35 
 
 		 269 aa  85.5  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  27.78 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  27.78 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  28.5 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  29.5 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  27.04 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  31.68 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  28.78 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  27.05 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  27.94 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  25.81 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  26.73 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  31.53 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  24.65 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  23.26 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  23.38 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  26.11 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  27.5 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  26.37 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  26.76 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>