50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0020 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
199 aa  395  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  84.26 
 
 
202 aa  343  8e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  81.73 
 
 
199 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  77.95 
 
 
198 aa  296  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  49.74 
 
 
209 aa  162  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  29.9 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  28.21 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  28.21 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  31 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  26.26 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  26.67 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  25.4 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  27.32 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  27.96 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  28.35 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  29.84 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  25.81 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  25.64 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  28.5 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  25.13 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  25.76 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  24.26 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  26.56 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  30.61 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  25.74 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  25.77 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  25 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  25.63 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  23.2 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  29.08 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  25.52 
 
 
250 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  25 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  26.9 
 
 
211 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.85 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  23.32 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  23.15 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  23.5 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  26.4 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  26.4 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  33.04 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  33.94 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  22.68 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  42.37 
 
 
258 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  25.12 
 
 
269 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  21.76 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  23.08 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  38.24 
 
 
255 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  31.43 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  37.1 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  27.27 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>