61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0258 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
207 aa  413  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  60.4 
 
 
214 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  60.4 
 
 
214 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  53.47 
 
 
209 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  53.69 
 
 
222 aa  224  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  55.17 
 
 
212 aa  221  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  52.71 
 
 
220 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  44.22 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  40.61 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  38.58 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  37.44 
 
 
216 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  38.07 
 
 
214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  37.56 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  38 
 
 
212 aa  115  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  35.82 
 
 
201 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  31.68 
 
 
232 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  30.96 
 
 
220 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  30.69 
 
 
209 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  29.59 
 
 
228 aa  99  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  31 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  28.79 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  30.81 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  29.06 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  31.37 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  30.33 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  30.58 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  27.04 
 
 
250 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  26.53 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  30.05 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  31.58 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33.51 
 
 
206 aa  87  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  29.35 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.88 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  27.46 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  30.6 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  34.33 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  26.26 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  28.93 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  27.92 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  28.37 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  26.74 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  25.52 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  26.2 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  29.56 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  26.24 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  26.24 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  24.62 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  26.26 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  24.26 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  24.62 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  27.42 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  25.13 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  23.27 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  24.87 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  23.74 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  24.35 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  20.21 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  23.65 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  25 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  25.89 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  22.81 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>