56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1009 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
212 aa  411  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  34.8 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  32.52 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  32.66 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  28.22 
 
 
208 aa  101  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  32 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  26.57 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  30.16 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  29.21 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  31.58 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  32.11 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  27.88 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  31.58 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  30.19 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  30.05 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  31.68 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  28.93 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  23.92 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  27.32 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  24.51 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  29.91 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  29.47 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  25.39 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  29.76 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  24.51 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  24.14 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  27.67 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  25.13 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  27.75 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  28.43 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  24.23 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  24.23 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  24.26 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  27.32 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  29.81 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  22.05 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  27.04 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  26.4 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  27.04 
 
 
250 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  25.45 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  25.45 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  24.87 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  23.74 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  23.53 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  23.32 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  24.62 
 
 
269 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  22.61 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  22.38 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  22.22 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  22.64 
 
 
264 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1552  V-type ATPase, D subunit  35.48 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  21.78 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  33.33 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  22.6 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1805  V-type ATP synthase subunit D  31.82 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  23.4 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>