63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2269 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  62.26 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  62.14 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  62.14 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  59.81 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  55.45 
 
 		 212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  53.69 
 
 		 207 aa  224  9e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  48.78 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  44.66 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  44.17 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  43.69 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  45.32 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  43.78 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  36.95 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  37.44 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  34.31 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  34.63 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  34.63 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  33.33 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  36.18 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  33.17 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  33.18 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  33.82 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  32.51 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  33.17 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  33.66 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  32.14 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  31.63 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  31.12 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  33.86 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  31.22 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  32.06 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  30.35 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  30.05 
 
 		 269 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  30.35 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  29.27 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  30.43 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  26.6 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  32.71 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  28.22 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  29.06 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  28.14 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  30.5 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  26.26 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  30.19 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  28.43 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  28.43 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  28.43 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  25.87 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  25.25 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  29.82 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  24.62 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  26.42 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  24.62 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.65 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  22.84 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  23.38 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  29.76 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1829  V-type ATP synthase subunit D  30.91 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  25.49 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  27.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  23.78 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>