25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1681 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0092  V-type ATP synthase subunit D  53.09 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1829  V-type ATP synthase subunit D  41.79 
 
 
201 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3225  V-type ATP synthase subunit D  33.86 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2895  V-type ATP synthase subunit D  32.8 
 
 
199 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0230756  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1805  V-type ATP synthase subunit D  28.64 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0580  V-type ATP synthase subunit D  34.98 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1552  V-type ATPase, D subunit  29.28 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  29.44 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  28.89 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  28.89 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  27.78 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  32.23 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  26.57 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  27.78 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  28.17 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  26.73 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  27.1 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  28.49 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  25 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  24 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  22.98 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  22.98 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  27.93 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  25.54 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>