12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0580 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0580  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  34.98 
 
 
204 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0092  V-type ATP synthase subunit D  33.85 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1829  V-type ATP synthase subunit D  31.31 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3225  V-type ATP synthase subunit D  32.32 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2895  V-type ATP synthase subunit D  31.47 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0230756  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1805  V-type ATP synthase subunit D  27.47 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  27.18 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  28.44 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1552  V-type ATPase, D subunit  26.37 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  27.78 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  26.92 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>