20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1829 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1829  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0092  V-type ATP synthase subunit D  41.87 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  41.79 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2895  V-type ATP synthase subunit D  34.02 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0230756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3225  V-type ATP synthase subunit D  33.51 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1805  V-type ATP synthase subunit D  29.33 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0580  V-type ATP synthase subunit D  31.16 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1552  V-type ATPase, D subunit  23.23 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  30.91 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  28.06 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  29.06 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  28.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  28.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  28.21 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  26.83 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  26.83 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  28.36 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  26.36 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  26.44 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  28.35 
 
 		 221 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>