61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1684 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  59.52 
 
 
214 aa  251  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  59.52 
 
 
214 aa  251  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  55.45 
 
 
222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  52.88 
 
 
209 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  55.17 
 
 
207 aa  221  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  52.4 
 
 
220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  47.8 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  38.24 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  37.75 
 
 
214 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  37.75 
 
 
214 aa  122  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  37.25 
 
 
214 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  36.76 
 
 
212 aa  121  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  38.05 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  37.07 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  35.86 
 
 
220 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  34.63 
 
 
232 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  34.98 
 
 
206 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  33.5 
 
 
207 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  34.13 
 
 
222 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  32.34 
 
 
225 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  32.65 
 
 
250 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  33.82 
 
 
206 aa  101  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  32.14 
 
 
239 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  31.71 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  31.68 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  32.99 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  30.39 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  32.52 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  32.08 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  30.24 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  29.81 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  32.52 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  32.18 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  29.41 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  26.87 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  33.5 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  32.08 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  31.19 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  31.38 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  29.06 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  26.9 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  29 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  29.33 
 
 
264 aa  72  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  27.32 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  25.7 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  28.79 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  26.87 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  26.52 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  28.5 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  26.73 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  28.23 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  26.53 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  28.64 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  26.42 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  23.5 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  23.76 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  23.5 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  28.28 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1829  V-type ATP synthase subunit D  26.36 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  24.77 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>