59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0591 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
214 aa  424  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  50.49 
 
 
209 aa  205  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  48.58 
 
 
209 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  48.53 
 
 
213 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  48.99 
 
 
220 aa  197  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  51.66 
 
 
208 aa  187  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  45.97 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  46 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  45.85 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  43.84 
 
 
231 aa  181  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  44.39 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  44.9 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  43.5 
 
 
207 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  43.37 
 
 
239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  42.78 
 
 
232 aa  161  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  42.79 
 
 
209 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  36.49 
 
 
216 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  34.83 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  36.84 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  34.33 
 
 
214 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  34.33 
 
 
214 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  35.32 
 
 
214 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  32.52 
 
 
209 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  31.37 
 
 
222 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  33.49 
 
 
214 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  33.49 
 
 
214 aa  101  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  32.08 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  34.93 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  32.86 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  31.22 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  30.05 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  32.21 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  29 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.82 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  33.03 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  26.11 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  29.27 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  25.77 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  29.13 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  34.34 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  26.73 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  28.92 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  33.84 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  32.16 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  32.49 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  27.86 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  22.93 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  28.99 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  26.92 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  24 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  27.62 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  25.6 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.79 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  21.76 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  22.22 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  23.85 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  22.35 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  29.53 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  27.59 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>