60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1757 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  43.22 
 
 
220 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  43.28 
 
 
207 aa  158  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  42.79 
 
 
206 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  42.51 
 
 
212 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  42.58 
 
 
211 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  42.11 
 
 
214 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  42.11 
 
 
214 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  44.06 
 
 
208 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  39.6 
 
 
209 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  42.51 
 
 
214 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  41.21 
 
 
231 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  41.09 
 
 
209 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  40.1 
 
 
213 aa  148  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  40.93 
 
 
232 aa  148  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  39.8 
 
 
225 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  39.81 
 
 
222 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  42.93 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  40.51 
 
 
250 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  38.97 
 
 
228 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  39.49 
 
 
239 aa  134  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  40.69 
 
 
221 aa  131  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  37.02 
 
 
216 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  33.33 
 
 
222 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  34.13 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  34.13 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  32.84 
 
 
215 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  32.69 
 
 
220 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  37.32 
 
 
225 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  33.66 
 
 
208 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  34.58 
 
 
214 aa  105  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  34.13 
 
 
212 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  29.7 
 
 
209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  31.37 
 
 
214 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  29.21 
 
 
209 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  29.21 
 
 
209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  30.77 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  31.31 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  30.58 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  30.2 
 
 
255 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  31.4 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  31.84 
 
 
201 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.25 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  27.67 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  25.47 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  27.88 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  30.54 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  27.88 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  26.24 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  26.5 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  27.78 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  27.18 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  29.76 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  27.1 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  25.87 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  23.2 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  23.59 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  21.94 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  19.23 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  26.32 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>