62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1137 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
216 aa  426  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  47.85 
 
 
212 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  46.38 
 
 
214 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  45.89 
 
 
214 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  45.89 
 
 
211 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  45.89 
 
 
214 aa  154  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  42 
 
 
225 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  41.24 
 
 
228 aa  148  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  40.7 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  41.71 
 
 
207 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  40.21 
 
 
250 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  40.5 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  37.98 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  41.21 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  39.18 
 
 
239 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  39 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  35.68 
 
 
225 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  39.09 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  39.3 
 
 
209 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  37.56 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  37.56 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  36.95 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  36.49 
 
 
214 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  35.35 
 
 
232 aa  123  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  37.02 
 
 
222 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  34.17 
 
 
208 aa  121  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  34.52 
 
 
206 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  37.44 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  39.5 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  37.25 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  36 
 
 
208 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  37.07 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  32 
 
 
209 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.96 
 
 
208 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  36.41 
 
 
221 aa  104  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  33.65 
 
 
222 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  35.35 
 
 
223 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  34.83 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  35.86 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  34.87 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  29.74 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  32.83 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  32.32 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  32.32 
 
 
209 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  31.19 
 
 
214 aa  91.7  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  33.66 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  33.17 
 
 
255 aa  89  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  28.36 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  26.57 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  29.1 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  30.05 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  32.99 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  26.02 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  28.57 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  28.23 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  27.32 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  23.92 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  26.29 
 
 
198 aa  58.5  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  27.18 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  29.49 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  25.39 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  25.39 
 
 
203 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>