62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1245 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  70.3 
 
 
207 aa  286  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  68 
 
 
220 aa  268  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  64.22 
 
 
209 aa  260  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  61.76 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  60.78 
 
 
213 aa  249  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  63.73 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  56.93 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  54.46 
 
 
225 aa  238  4e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  58.08 
 
 
250 aa  237  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  57.58 
 
 
228 aa  234  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  57.07 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  56.7 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  45.85 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  48.76 
 
 
212 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  49.25 
 
 
211 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  49.25 
 
 
214 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  48.76 
 
 
214 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  49.25 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  40.49 
 
 
214 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  42.79 
 
 
222 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  41.21 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  38.54 
 
 
209 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  34.63 
 
 
222 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  35.18 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  32.68 
 
 
220 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  33.5 
 
 
214 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  33.5 
 
 
214 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  33.33 
 
 
222 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  35.61 
 
 
225 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  33.33 
 
 
201 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  33.99 
 
 
223 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  33.82 
 
 
212 aa  101  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  33.97 
 
 
208 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  31.71 
 
 
208 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  31 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  35.19 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  32.68 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  35.92 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  31.07 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  30.65 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  30.96 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  27.04 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  27.04 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  27.04 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  27.84 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  30 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  28.37 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  27.88 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  29.7 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.07 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  27.14 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  31.19 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  27.75 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  29.08 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  27.92 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  29.21 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  23.24 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  25.93 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  27.5 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  25.91 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  24.61 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>