51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2162 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  77.95 
 
 		 199 aa  317  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  76.29 
 
 		 199 aa  303  7e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  74.49 
 
 		 202 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  48 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  30.46 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  29.23 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  29.23 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  28.64 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  28.78 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  27.64 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  27.23 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  26 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  25.87 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  30.93 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  28.21 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  27.5 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  25.4 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  27.98 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  24.1 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  27.23 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  26.15 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  29.17 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  26.83 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  24.15 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  25 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  24.62 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  23.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  47.46 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  39.13 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.13 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  27.95 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  46.58 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  23.2 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  24.02 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  23.83 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  24.37 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  24.37 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  22.01 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  26.67 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  27.41 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  23.53 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  23.53 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  23.08 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  22.39 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  34.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  22.01 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  39.71 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  40.35 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  24.88 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  25.59 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>