62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0289 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  80.29 
 
 		 209 aa  344  6e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  79.81 
 
 		 209 aa  339  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  75.85 
 
 		 213 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  74.75 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  63.73 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  56.93 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  58.13 
 
 		 207 aa  237  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  53.69 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  55.84 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  54.82 
 
 		 239 aa  224  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  53.81 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  51.52 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  51.66 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  49.26 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  48.77 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  45.85 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  45.85 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  45.85 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  46.31 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  45.1 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  44.06 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  36 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  33.66 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  33.81 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  33.81 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  35 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33.17 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  33.33 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  34.83 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  35.82 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  35.27 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  32.52 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  31.58 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  30.2 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  34.5 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  32.2 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.47 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  32.02 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  29.5 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  29.5 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  31.16 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  29 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  30.1 
 
 		 258 aa  85.1  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  28.43 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  27.09 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  29.06 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  27.64 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  29.21 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  30.85 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  29.81 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  29.61 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  28.06 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  25 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  28.02 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  25.59 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  28.74 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  25.57 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  25.79 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0092  V-type ATP synthase subunit D  24.86 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>