60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3358 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
250 aa  493  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  95.48 
 
 
239 aa  380  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  84.47 
 
 
231 aa  350  1e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  84.92 
 
 
228 aa  346  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  82.27 
 
 
225 aa  340  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  58.13 
 
 
206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  56.22 
 
 
220 aa  236  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  55.17 
 
 
209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  57.56 
 
 
207 aa  232  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  54.19 
 
 
209 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  51.23 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  56.16 
 
 
208 aa  218  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  50 
 
 
232 aa  205  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  44.83 
 
 
214 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  42.36 
 
 
214 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  43.13 
 
 
214 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  43.13 
 
 
214 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  43.27 
 
 
211 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  43.35 
 
 
212 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  42.65 
 
 
214 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  40.7 
 
 
216 aa  146  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  39.44 
 
 
222 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  35.96 
 
 
209 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  36.06 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  35.58 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  35.58 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  35.5 
 
 
209 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  32.18 
 
 
206 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  33.17 
 
 
212 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  32.56 
 
 
220 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  31.94 
 
 
222 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  29.41 
 
 
208 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  31.92 
 
 
222 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.37 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  32.24 
 
 
223 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  33.33 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  32.84 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  32.06 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  28.63 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  30.81 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.84 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  26.37 
 
 
209 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  26.37 
 
 
209 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  26.6 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  26.5 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  26.37 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  27.05 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  24.88 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  27.23 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  27.05 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  27.32 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  28.24 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  23.12 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  25.77 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  25.13 
 
 
202 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  23.9 
 
 
199 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  24.87 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  24.24 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  28.49 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>