61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1607 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  57 
 
 		 207 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  56.57 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  54.04 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  49.29 
 
 		 213 aa  228  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  49.27 
 
 		 209 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  50.74 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  48.54 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  49.5 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  51.71 
 
 		 208 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  50 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  50 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  47.21 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  42.16 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  44.71 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  44.55 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  39.91 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  43.93 
 
 		 214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  43.93 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  43.78 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  38.38 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  34.45 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  35.78 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  37.33 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  34.62 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  34.72 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  34.72 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  33.33 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  34.93 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  37.21 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33.33 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  34.76 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  32.32 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  32.35 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  31.86 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  36.67 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  34.52 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  32.06 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  31.34 
 
 		 208 aa  98.6  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  31.6 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  33.83 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  30.05 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  30.05 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  30.05 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  28.99 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  27.72 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  33.02 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  29.33 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  26.53 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  29.5 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  26.29 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  29.29 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  25.23 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  26.67 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  26.8 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  23.81 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  22.61 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  30 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  23 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  32.39 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  27.13 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>