59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51058 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  100 
 
 
255 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  45.1 
 
 
264 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  47.21 
 
 
269 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  42.72 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  41.98 
 
 
216 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  33.49 
 
 
214 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  32.57 
 
 
214 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  32.57 
 
 
214 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  32.39 
 
 
212 aa  105  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  31.88 
 
 
211 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  29.96 
 
 
222 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  33.17 
 
 
216 aa  89  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  33.17 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  29.19 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  26.96 
 
 
225 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  30 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  31.02 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  26.02 
 
 
228 aa  79  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  30.37 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  30.65 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  27.94 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  25.12 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  26.53 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  29.65 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  29.65 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  26.53 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  29.59 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  28.93 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  29.61 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  29.85 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  25.98 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  30.39 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  29.03 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  26.73 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  28.79 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  25.91 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  30.49 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  26.96 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  25.13 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  27.05 
 
 
212 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  23.74 
 
 
213 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  25.25 
 
 
208 aa  58.9  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  26.21 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  32.08 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  28.11 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  23.5 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  25.71 
 
 
209 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  25.71 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  22.22 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  25.24 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  24.88 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  25.48 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  23.83 
 
 
206 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  39.71 
 
 
209 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  38.24 
 
 
199 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  25.73 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  35.29 
 
 
202 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  35.29 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  20.6 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>