63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0283 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  86.41 
 
 		 231 aa  361  5.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  85.78 
 
 		 225 aa  357  9e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  84.92 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  83.92 
 
 		 239 aa  342  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  57.92 
 
 		 206 aa  241  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  57.21 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  54.68 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  52.71 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  55.17 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  50.25 
 
 		 213 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  54.68 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  47.21 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  45.15 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  45.71 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  45.19 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  44.81 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  44.81 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  44.81 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  41.38 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  40.57 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  38.43 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  36.45 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  35.41 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  36.54 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  36.54 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  31.22 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  35.68 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  33.49 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  33.33 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  33.5 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  32.52 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  33.33 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  29.8 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  33.98 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  32.85 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  28.78 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  32.2 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  33 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  32.34 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  27.23 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  28.08 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  30.77 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  25.87 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  26.26 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  26.26 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  26.26 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  27 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.63 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  26.5 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  26.54 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  26.57 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  26.13 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  24.5 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  25.26 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  26.83 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  25.25 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  22.09 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  21.74 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  28.43 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1681  V-type ATP synthase subunit D  25 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  22.28 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>