61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1185 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  100 
 
 
209 aa  410  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  81.82 
 
 
209 aa  355  2.9999999999999997e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  77.99 
 
 
213 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  80.29 
 
 
208 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  75.25 
 
 
220 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  61.76 
 
 
206 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  59.11 
 
 
207 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  56.44 
 
 
225 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  55.22 
 
 
231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  53.81 
 
 
239 aa  228  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  53.81 
 
 
250 aa  225  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  51.78 
 
 
228 aa  219  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  48.99 
 
 
232 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  48.58 
 
 
214 aa  204  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  43.96 
 
 
214 aa  185  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  46.15 
 
 
212 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  45.19 
 
 
211 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  45.19 
 
 
214 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  45.19 
 
 
214 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  44.71 
 
 
214 aa  161  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  43.14 
 
 
209 aa  161  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  39.6 
 
 
222 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  39 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  33.17 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  33.66 
 
 
214 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  33.96 
 
 
209 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  33.66 
 
 
214 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  34.16 
 
 
206 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  35.82 
 
 
222 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  32.67 
 
 
208 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  35.07 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  34.33 
 
 
223 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  33 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  31.71 
 
 
220 aa  98.2  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  31.37 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  33.5 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  30.24 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  31.47 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  31.19 
 
 
258 aa  89.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  27.78 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 
209 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  26.77 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  27.27 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  30.14 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  33.17 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  27.92 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  28.08 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.87 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  29.38 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  28.86 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  30.54 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  25.37 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  26.19 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  27.32 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  23.88 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  20.71 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  22.68 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0340  V-type ATPase, D subunit  24.64 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00110  vacuolar ATP synthase subunit D, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11920)  27.27 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  22.61 
 
 
202 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3464  H+transporting two-sector ATPase D subunit  25.39 
 
 
203 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  normal  0.594874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>