167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3440 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  80.94 
 
 
391 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.94 
 
 
391 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  87.73 
 
 
384 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.94 
 
 
391 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
386 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  31.88 
 
 
760 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  30 
 
 
393 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.24 
 
 
411 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.97 
 
 
399 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.97 
 
 
399 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.83 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.19 
 
 
386 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.61 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.73 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.66 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.45 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.34 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  30.83 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.73 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  32.09 
 
 
405 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.76 
 
 
413 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.7 
 
 
434 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  33.24 
 
 
376 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.08 
 
 
404 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.94 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.65 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.76 
 
 
392 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.76 
 
 
392 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.93 
 
 
397 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.93 
 
 
397 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.13 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.84 
 
 
397 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.51 
 
 
392 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.53 
 
 
399 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.03 
 
 
376 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.52 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.73 
 
 
388 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.12 
 
 
405 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.99 
 
 
393 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.46 
 
 
392 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  27.4 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.87 
 
 
391 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.44 
 
 
390 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.4 
 
 
388 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  27.12 
 
 
406 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.96 
 
 
397 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.82 
 
 
392 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.27 
 
 
394 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.45 
 
 
393 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.78 
 
 
392 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.65 
 
 
394 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.18 
 
 
391 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.25 
 
 
390 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.94 
 
 
433 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  26.55 
 
 
427 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.5 
 
 
394 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.29 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  28.1 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  28.03 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.09 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  27.36 
 
 
394 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.98 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  25.92 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.89 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.89 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.89 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.37 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  25.7 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.41 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.43 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  26.87 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.2 
 
 
387 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.2 
 
 
387 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.74 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.04 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.74 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  28.11 
 
 
402 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  29.14 
 
 
433 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.01 
 
 
394 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.4 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  24.86 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.16 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.15 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  27.27 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.15 
 
 
421 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.27 
 
 
389 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.32 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.9 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.47 
 
 
393 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.2 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.2 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  28.96 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.42 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.4 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  26.51 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  21.89 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.22 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.81 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.81 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.05 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>