296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3521 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  92.44 
 
 
397 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  92.7 
 
 
397 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
397 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  90.93 
 
 
397 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  98.24 
 
 
397 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  92.7 
 
 
397 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  80.4 
 
 
398 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  83.11 
 
 
392 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  70.54 
 
 
399 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  65.86 
 
 
405 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  65.86 
 
 
405 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.95 
 
 
376 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.27 
 
 
386 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.79 
 
 
389 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.4 
 
 
386 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.31 
 
 
396 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.47 
 
 
387 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.34 
 
 
388 aa  322  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.46 
 
 
397 aa  205  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.69 
 
 
394 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  33.42 
 
 
393 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  35.8 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.77 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.77 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.52 
 
 
399 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.1 
 
 
393 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.28 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.33 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  28.13 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.65 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.51 
 
 
397 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  28.9 
 
 
413 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.58 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.77 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.77 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.77 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.69 
 
 
397 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.4 
 
 
433 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  32.71 
 
 
370 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.85 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.64 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  25.9 
 
 
402 aa  126  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.34 
 
 
400 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.38 
 
 
395 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.97 
 
 
384 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  30.27 
 
 
415 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.6 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.02 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  28.65 
 
 
402 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.45 
 
 
388 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.16 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.98 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  28.89 
 
 
427 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.68 
 
 
407 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.7 
 
 
390 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.88 
 
 
396 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.19 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  30.71 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.31 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.71 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.3 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.67 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  25.61 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  24.86 
 
 
394 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
394 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
394 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  28.07 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.8 
 
 
410 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.01 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.87 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.27 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.18 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  27.96 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.65 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.58 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.46 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  29.2 
 
 
636 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.88 
 
 
393 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  30.4 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.32 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  27.63 
 
 
397 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  29.43 
 
 
760 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.33 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.01 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.33 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.63 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.19 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.4 
 
 
393 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  29.06 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.77 
 
 
394 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.49 
 
 
393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.49 
 
 
393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.49 
 
 
393 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.23 
 
 
404 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  25.77 
 
 
468 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  25.34 
 
 
389 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>