More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0920 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
394 aa  811    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  74.87 
 
 
394 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.34 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.34 
 
 
394 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  72.08 
 
 
394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.08 
 
 
394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.08 
 
 
394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  62.5 
 
 
391 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.48 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.53 
 
 
390 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.78 
 
 
390 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  49.87 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  47.09 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.78 
 
 
399 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.69 
 
 
393 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.69 
 
 
393 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.43 
 
 
393 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.44 
 
 
393 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.31 
 
 
397 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  37.82 
 
 
413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.84 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.9 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.29 
 
 
393 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.29 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.29 
 
 
403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.73 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.31 
 
 
392 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.31 
 
 
392 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.83 
 
 
392 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.95 
 
 
407 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  36.95 
 
 
415 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  33.95 
 
 
402 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.68 
 
 
397 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.92 
 
 
397 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.29 
 
 
410 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  32.88 
 
 
397 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.39 
 
 
389 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  33.68 
 
 
409 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
390 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.82 
 
 
390 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  34.36 
 
 
389 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.63 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  33.42 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.56 
 
 
404 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  33.67 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.53 
 
 
406 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.69 
 
 
391 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.05 
 
 
370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.43 
 
 
396 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.06 
 
 
387 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.12 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  30.47 
 
 
636 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.21 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.76 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.76 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.66 
 
 
392 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  32.16 
 
 
370 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.89 
 
 
392 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.37 
 
 
394 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.6 
 
 
390 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.21 
 
 
391 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.45 
 
 
394 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.65 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.8 
 
 
392 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.69 
 
 
418 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.62 
 
 
393 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.38 
 
 
398 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  28.03 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.85 
 
 
387 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.96 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.97 
 
 
395 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  30.13 
 
 
427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  27.97 
 
 
415 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  24.61 
 
 
383 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.2 
 
 
397 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  27.22 
 
 
377 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.54 
 
 
361 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.94 
 
 
397 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.28 
 
 
389 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  25.79 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.61 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.07 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.56 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.62 
 
 
397 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.67 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.67 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.1 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  27.06 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.2 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.3 
 
 
414 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.98 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  26.05 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  24.93 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  25.75 
 
 
405 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  23.73 
 
 
429 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.25 
 
 
433 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  24.72 
 
 
398 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.6 
 
 
399 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>