253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2161 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  82.4 
 
 
397 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 
392 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  83.91 
 
 
397 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  83.65 
 
 
397 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  83.87 
 
 
397 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.82 
 
 
397 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  83.11 
 
 
397 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  79.68 
 
 
398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  65.74 
 
 
405 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  64.99 
 
 
405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  68.6 
 
 
399 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.25 
 
 
376 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.14 
 
 
386 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.16 
 
 
389 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.72 
 
 
396 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.61 
 
 
386 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.19 
 
 
387 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.26 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.75 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.15 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  31.43 
 
 
393 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  34.57 
 
 
376 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.52 
 
 
399 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.9 
 
 
404 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.55 
 
 
393 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  32.36 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.36 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  28.45 
 
 
406 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  28.36 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.4 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.57 
 
 
397 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.19 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  26.44 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.72 
 
 
397 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.53 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.12 
 
 
403 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  30.32 
 
 
424 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.35 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.18 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.41 
 
 
392 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.95 
 
 
389 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.57 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  25.41 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.18 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.41 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.73 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  29.29 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  29.89 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.03 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.8 
 
 
394 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.26 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  25.2 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.2 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  27.58 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.34 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.34 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.42 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.34 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.8 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.39 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.15 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.5 
 
 
390 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.22 
 
 
390 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.73 
 
 
407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.3 
 
 
390 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.66 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  30 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.27 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.54 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.58 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  24.31 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.31 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.31 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  26.54 
 
 
402 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.88 
 
 
391 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.27 
 
 
390 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.86 
 
 
387 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.18 
 
 
392 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 
387 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.68 
 
 
388 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.51 
 
 
391 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.25 
 
 
393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.25 
 
 
393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.6 
 
 
387 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.31 
 
 
394 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.25 
 
 
393 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  27.79 
 
 
636 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  29.44 
 
 
409 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  28.61 
 
 
383 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.69 
 
 
403 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  25.06 
 
 
389 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  29.4 
 
 
760 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.69 
 
 
403 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  28.87 
 
 
415 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.74 
 
 
384 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.46 
 
 
386 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.11 
 
 
389 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.44 
 
 
396 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.88 
 
 
392 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.07 
 
 
411 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>