More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2837 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
399 aa  786    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.08 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  33.69 
 
 
393 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.79 
 
 
397 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.96 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.34 
 
 
392 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.72 
 
 
397 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.68 
 
 
397 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.68 
 
 
397 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.68 
 
 
397 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.34 
 
 
397 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.34 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  36.51 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.4 
 
 
399 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.4 
 
 
397 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.46 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30.27 
 
 
405 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  30.3 
 
 
398 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.53 
 
 
392 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.41 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  30.51 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  32.8 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.8 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.37 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.07 
 
 
376 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.5 
 
 
390 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.16 
 
 
388 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
402 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.82 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.53 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.12 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  27.18 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  29.87 
 
 
415 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.82 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.89 
 
 
397 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.26 
 
 
386 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  30.08 
 
 
760 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.42 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.42 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.42 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  30.2 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.42 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.42 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.33 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.16 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.16 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.16 
 
 
387 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.92 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.24 
 
 
404 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.38 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.4 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.4 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.25 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.81 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.62 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  27.69 
 
 
394 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.59 
 
 
407 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  28.27 
 
 
402 aa  126  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  30.56 
 
 
370 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.42 
 
 
388 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.06 
 
 
394 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.29 
 
 
384 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  29.17 
 
 
409 aa  123  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.76 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.14 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.94 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.87 
 
 
393 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.31 
 
 
394 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.87 
 
 
393 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.28 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  27.65 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.45 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.45 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.45 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.13 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.23 
 
 
394 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.93 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.53 
 
 
398 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  27.44 
 
 
397 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.27 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.94 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0150  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.41 
 
 
394 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.95 
 
 
418 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.95 
 
 
400 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.68 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.9 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.35 
 
 
370 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.94 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.94 
 
 
390 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.2 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.57 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0955  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.08 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  30.85 
 
 
636 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  26.87 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.04 
 
 
395 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.43 
 
 
434 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.02 
 
 
389 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.85 
 
 
389 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.75 
 
 
392 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>