288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0705 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  100 
 
 
385 aa  804    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.92 
 
 
434 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  37.97 
 
 
405 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.46 
 
 
394 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  25.9 
 
 
393 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.41 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.28 
 
 
361 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.34 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.72 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.45 
 
 
397 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  28.16 
 
 
381 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.3 
 
 
392 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  24.36 
 
 
402 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.6 
 
 
392 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.58 
 
 
397 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.95 
 
 
397 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  27.86 
 
 
377 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.53 
 
 
386 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.68 
 
 
397 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.18 
 
 
397 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.2 
 
 
393 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.92 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.68 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.83 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  25.69 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  25.34 
 
 
406 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.62 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.34 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.94 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.54 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  27.25 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  24.87 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.61 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  23.12 
 
 
405 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.04 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.76 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.2 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.43 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.22 
 
 
399 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.76 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.36 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.14 
 
 
390 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.93 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  24.51 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  25.48 
 
 
370 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.18 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  23.73 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.23 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.47 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  24.05 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.93 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.05 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.95 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  22.77 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.49 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.39 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.93 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  23.77 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.77 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.77 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.38 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  24.28 
 
 
760 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.45 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  25.5 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.45 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  22.38 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.57 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.08 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.59 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4333  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.48 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619225  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5139  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.46 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0630041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  22.11 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5014  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.92 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  23.22 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.22 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.22 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.19 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  22.62 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.81 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.21 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4154  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.47 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.02 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  26.23 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.58 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.34 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1173  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.31 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4109  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  24.73 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4257  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.73 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00125865  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  21.89 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  24.78 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1754  Acyl-CoA dehydrogenase  24.18 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0523  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.17 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.72 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3681  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.66 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  21.96 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.19 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>