157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5299 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  100 
 
 
391 aa  789    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
391 aa  789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  83.07 
 
 
384 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
391 aa  789    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.94 
 
 
386 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  32.96 
 
 
760 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  31.61 
 
 
393 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.56 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 
397 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.75 
 
 
386 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.73 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.06 
 
 
389 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.53 
 
 
394 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.24 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.77 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.24 
 
 
397 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.25 
 
 
413 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.75 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.97 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  31.05 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.14 
 
 
397 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.71 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.3 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  32.6 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.68 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  28.61 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.35 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.37 
 
 
387 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.79 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.45 
 
 
376 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.77 
 
 
434 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  30.26 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.65 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.65 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.07 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.64 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.4 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.34 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.45 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.96 
 
 
393 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.44 
 
 
391 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.16 
 
 
388 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.02 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.74 
 
 
390 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.2 
 
 
393 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.59 
 
 
394 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  28.49 
 
 
405 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.01 
 
 
392 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.76 
 
 
391 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.49 
 
 
433 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  29.22 
 
 
409 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.4 
 
 
392 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.23 
 
 
394 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  27.42 
 
 
427 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.01 
 
 
390 aa  99.8  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.69 
 
 
393 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.45 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.86 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  27.47 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.39 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.13 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.13 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.21 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.45 
 
 
394 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.29 
 
 
403 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.29 
 
 
403 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  26.91 
 
 
402 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  28.81 
 
 
370 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.67 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.67 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.8 
 
 
396 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.93 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.95 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.67 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.85 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.76 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.27 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.54 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.97 
 
 
410 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.26 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.26 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.26 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.26 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  25.43 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  26.58 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  27.1 
 
 
415 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  27.15 
 
 
433 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.72 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.22 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.15 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.93 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  26.15 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  29.32 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.06 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.51 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.16 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  23.93 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>