299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0937 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  100 
 
 		 409 aa  828    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  83.66 
 
 		 409 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.81 
 
 		 421 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.2 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  36.68 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.75 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.94 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.91 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  34.83 
 
 		 413 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.08 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  36.08 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.08 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.49 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.14 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.72 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.1 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.68 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.62 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  34.82 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  35.64 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.8 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  35.7 
 
 		 405 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.64 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.92 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.38 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.66 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.67 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.67 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.94 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  32.02 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  33.42 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.43 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  32.55 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  28.76 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.89 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.87 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.55 
 
 		 394 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.76 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.66 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.19 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.4 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.4 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.92 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.92 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  33 
 
 		 636 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.63 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.21 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.73 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.29 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.67 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.52 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.4 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.4 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.77 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.57 
 
 		 393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.95 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  29.31 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  32.29 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.69 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.03 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.81 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.03 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.18 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.87 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.24 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.76 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.3 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  27.82 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.01 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.71 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.81 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  29.59 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  31.54 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  30.36 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.13 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.17 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.26 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.1 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  29.81 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.53 
 
 		 397 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.28 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  28.64 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  27.42 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.44 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  29.1 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.01 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.71 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.88 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.74 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.83 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.83 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.04 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.38 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  27.56 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.88 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>